Skip to main content

Table 1 The microRNA targets regulated by SST

From: Sho-saiko-to, a traditional herbal medicine, regulates gene expression and biological function by way of microRNAs in primary mouse hepatocytes

Temporal up-pattern
MicroRNA* Target symbol Target entrez MicroRNA Target symbol Target entrez MicroRNA Target symbol Target entrez
miR-495-3p Depdc1b 218581 miR-19b-2-5p Sprr2a2 1E + 08 miR-3089-3p Scara3 219151
  Slc1a2 20511   Mbnl3 171170   Rad51 19361
  Steap2 74051   Cep55 74107 miR-3095-5p Gsta3 14859
  Zmat1 215693   Tia1 21841   Ccnd1 12443
  Fmo5 14263 miR-3092-5p Cln6 76524 miR-30c-5p Fam43a 224093
  Ckap4 216197   Lass3 545975   Fam49a 76820
  Bcl2l15 229672   Gsto1 14873 miR-322-3p Ugdh 22235
  Bst1 12182   C1qtnf1 56745   Mybl1 17864
  Pttg1 30939 miR-450a-2-3p Slc7a2 11988 miR-343 Mybl2 17865
  Osbpl3 71720   Slc1a2 20511   Nfasc 269116
  Esco2 71988   Steap2 74051 miR-380-5p Cdon 57810
  4930547N16Rik 75317   Dcdc2a 195208   Ccdc89 70054
miR-669d-3p Cenpi 102920 miR-466 k Zscan29 99334 miR-410-3p Pla2r1 18779
  Cysltr1 58861   Dcdc2a 195208   Sema3e 20349
  Gnai1 14677   Ptchd1 211612 miR-449a-5p Gpr64 237175
  Zmat1 215693   Saa4 20211   H6pd 100198
  Rgs4 19736 miR-653-3p Igf2bp1 140486 miR-466n-3p Mest 17294
  Kif23 71819   Nfasc 269116   Dcdc2a 195208
  Fam55c 385658   Ect2 13605 miR-467 g Cxcl5 20311
  Birc5 11799   Lox 16948   Dcdc2a 195208
  Aspm 12316 miR-669 h-3p Snap25 20614 miR-5113 Gbp4 17472
  Bub1 12235   Steap2 74051   Slc7a2 11988
  Oip5 70645   Cysltr1 58861 miR-670-3p Evl 14026
  Ckap2 80986   Rgs4 19736   Bcl2l15 229672
miR-98-3p Clspn 269582 miR-697 Ckap4 216197 miR-692 Marcks 17118
  Zfpm2 22762   Slc1a2 20511   Dcdc2a 195208
  Nfasc 269116   Fzd8 14370 miR-693-3p Akr1c14 105387
  Ect2 13605   Klf15 66277   Nfasc 269116
  Ccna2 12428 miR-881-5p Serpine1 18787 miR-701-3p 1700029I01Rik 70005
  Rad51 19361   Slc1a2 20511   Dcdc2a 195208
  Dock11 75974   Steap2 74051 miR-758-3p Tpx2 72119
miR-21-3p Nuf2 66977   Fmo5 14263   Zfpm2 22762
  Steap2 74051 miR-9-5p Fam132b 227358 miR-875-3p Cxcl3 330122
  Zfpm2 22762   Lhfp 108927   Ehf 13661
  Fgf13 14168   Galnt3 14425 miR-122-5p Samd5 320825
  Sema3e 20349   Sort1 20661 miR-134-5p H6pd 100198
  Top2a 21973 let-7f-2-3p Gm13154 433804 miR-182-3p Lhfpl2 218454
miR-30b-5p Igf2bp1 140486   Fam164a 67306 miR-188-5p Rspo3 72780
  Slc1a2 20511   Ypel1 106369 miR-1892 Slc7a2 11988
  Cysltr1 58861 miR-107-3p Rttn 246102 miR-1897-5p Marcks 17118
  Gnai1 14677   Zfpm2 22762 miR-193-3p Abcc4 239273
  Lox 16948   Shcbp1 20419 miR-193-5p Tspyl3 241732
  Nedd4l 83814 miR-124-5p Klhl13 67455 miR-1950 Axl 26362
miR-30d-5p Prr11 270906   Steap2 74051 miR-1953 Steap2 74051
  Cysltr1 58861   Cd24a 12484 miR-195-3p Cebpd 12609
  Gnai1 14677 miR-1947-3p Prrx1 18933 miR-200a-5p Fgf13 14168
  Lox 16948   Slc1a2 20511 miR-200b-3p Lhfp 108927
  Rnf219 72486   Steap2 74051 miR-203-5p Abcc4 239273
  Nedd4l 83814 miR-200a-3p Thbd 21824 miR-206-3p Nedd9 18003
miR-466a-5p Prc1 233406   Mbnl3 171170 miR-214-3p Slc7a2 11988
  Slc1a2 20511   Lhfp 108927 miR-216b-3p Akr1c14 105387
  Steap2 74051 miR-291b-3p Rtn1 104001 miR-25-5p Zfp365 216049
  Fam55c 385658   Kif23 71819 miR-298-3p Ccdc89 70054
  Fgf23 64654   Kit 16590 miR-29c-3p Pxdn 69675
  Amotl1 75723 miR-29b-2-5p Fam55c 385658 miR-3062-5p Ccdc89 70054
miR-466o-3p Gtse1 29870   Gnai1 14677 miR-3063-5p Pak3 18481
  Zmat1 215693   Zmat1 215693 miR-3064-5p Fbln2 14115
  Kif23 71819 miR-466i-3p Tnfaip2 21928 miR-3075-3p Wisp1 22402
  Aspm 12316   Slc7a2 11988 miR-3085-3p Abcc1 17250
  Gpr64 237175   Gbp4 17472 miR-3094-5p Fgf23 64654
  Serpinb1b 282663 miR-669c-3p Tnfaip2 21928 miR-3103-3p Scarf2 224024
miR-669 l-3p Bmf 171543   Slc7a2 11988 miR-3112-5p Ptchd1 211612
  Fzd8 14370   Adm 11535 miR-322-5p Fam164a 67306
  Kit 16590 miR-669e-3p Tia1 21841 miR-326-5p Aif1l 108897
  Serpinb1b 282663   Fgf13 14168 miR-335-5p Gclc 14629
  Trim59 66949   Pak3 18481 miR-3473d B4galt6 56386
  Bmper 73230 miR-101a-3p Sult4a1 29859 miR-363-3p Adm 11535
miR-30a-5p Prr11 270906   Mbnl3 171170 miR-376c-5p Prrx1 18933
  Cysltr1 58861 miR-101a-5p Klhl13 67455 miR-378-3p Sema3e 20349
  Gnai1 14677   Mbnl3 171170 miR-378b Igf2bp3 140488
  Rnf219 72486 miR-101b-3p Sult4a1 29859 miR-380-3p Mbnl3 171170
  Nedd4l 83814   Mbnl3 171170 miR-382-3p Sdpr 20324
miR-30e-5p Prr11 270906 miR-105 Ect2 13605 miR-409-3p Akr1c14 105387
  Cysltr1 58861   Zfpm2 22762 miR-431-5p Klf15 66277
  Gnai1 14677 miR-142-5p Depdc1a 76131 miR-463-5p Pla2r1 18779
  Lox 16948   Igf2bp3 140488 miR-466i-5p Dcdc2a 195208
  Rnf219 72486 miR-181b-1-3p Fgf13 14168 miR-466 l-3p Snhg11 319317
miR-543-3p Mlf1 17349   Slc1a2 20511 miR-470-5p Steap4 117167
  Slc1a2 20511 miR-1912-3p Gpr137b 83924 miR-484 Csf1 12977
  Cysltr1 58861   Ptchd1 211612 miR-496-3p Tspan8 216350
  Fut4 14345 miR-1942 Mxra8 74761 miR-499-5p Cdk1 12534
  Kifc2 16581   Zfpm2 22762 miR-5101 Il5ra 16192
let-7a-2-3p 4930486L24Rik 214639 miR-1a-1-5p Ehf 13661 miR-5125 Mllt11 56772
  Sema3e 20349   Dcdc2a 195208 miR-5127 Col4a5 12830
  Cd24a 12484 miR-1b-5p Ugt2b35 243085 miR-5133 Rasl12 70784
  Pamr1 210622   Tlr4 21898 miR-544-3p Snhg11 319317
miR-137-3p Glis2 83396 miR-219-5p Tnfsf15 326623 miR-675-3p Mbnl3 171170
  Nfasc 269116   Gprc5b 64297 miR-677-5p Gclc 14629
  Cep55 74107 miR-26a-5p Hpgd 15446 miR-712-5p Cep55 74107
  Birc5 11799   Rgs4 19736 miR-7a-5p Mlph 171531
miR-149-5p B4galt6 56386 miR-294-3p Lass3 545975 miR-877-3p Npr3 18162
  Pak3 18481   Zfpm2 22762 miR-879-5p Hmmr 15366
  Il5ra 16192 miR-29a-3p Col5a3 53867 miR-881-3p Ehf 13661
  Axl 26362   Ppic 19038    
miR-194-5p Gas2l3 237436 miR-3066-5p Gpt2 108682    
  Fam164a 67306   Ccna2 12428    
  Ppic 19038 miR-3071-5p Igf2bp1 140486    
  Trim59 66949   Mbnl3 171170    
miR-1964-5p Csdc2 105859 miR-204-3p Kirrel3 67703 miR-465c-5p Ugt2b1 71773
  Kirrel3 67703 miR-23a-3p Cyp3a11 13112 miR-466b-3p Oas3 246727
let-7e-5p Cyp2c50 107141 miR-295-5p Aldob 230163 miR-466f-3p Npat 244879
miR-126-5p Ugt3a2 223337 miR-30e-3p Cyp2f2 13107 miR-466 m-3p Oas3 246727
miR-181a-5p Nipal1 70701 miR-328-5p Cyp2d22 56448 miR-5131 Ccdc85b 240514
miR-181b-5p Nipal1 70701 miR-344f-5p Scd1 20249 miR-551b-5p 5033411D12Rik 192136
miR-1960 Mrc1 17533 miR-3470a Dnahc17 69926 miR-676-5p Slc27a5 26459
miR-19b-1-5p Npat 244879 miR-465a-5p Ugt2b1 71773 miR-707 Slco1a1 28248
  1. *The MicroRNA name is obtained from the MicroRNA Database (miRDB version 4.0) website (http://mirdb.org) [27, 28].